Veja no artigo a como excluir um certificado pdf do seu sistema SIVS.
Lembrando que caso seja reutilizado o número do certificado, ele apresentará o histórico de arquivos importados, mas só aparecerá o arquivo mais recente importado.
Requisitos: permissão 2.
Vá no módulo de calibração.

Clique em Certificado PDF, no menu lateral.

Depois escolha o certificado desejado.

Dentro do certificado, clique em funções > Excluir;

Confirme a exclusão.

Certificado excluído.